仕事用環境のMacBook Pro 2011のLionでTimeMachineが動き出すとフリーズする減少に悩まされていたのですが、Time Machine Editerで2時間ごとにバックアップを取るとフリーズしなくなりました。
この問題、仕事用のマシンでLionの起動直後に色々いっぺんにアプリを起動している途中でTime Machineが動き出すとフリーズするという、かなり限定的なパターンで起きるのですが、最近やたら頻繁に起こっていたので、この方法をとったところ、どうやら回避できたようです。
OS X Lionでも動作するようです。
類似ソフトに「TimeMachineScheduler」というものもある。
バージョン3.1以降でLionに正式対応しているのでこちらの方が良いのかも。